Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbp1Q00915 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms