Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms