Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited1P97769 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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