Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SgcdP82347 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SgcdP82347 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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