Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crnkl1P63154 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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