Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Lmo4P61969 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms