Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms