Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Sh3bp1P55194 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Sh3bp1P55194 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Sh3bp1P55194 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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