Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ephb4P54761 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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