Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XpcP51612 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XpcP51612 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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