Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa11P50709 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms