Protein–RNA interactions for Protein: P48381

Rfx3, Transcription factor RFX3, mousemouse

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx3P48381 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rfx3P48381 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rfx3P48381 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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