Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbP41155 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LtbP41155 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LtbP41155 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LtbP41155 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LtbP41155 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LtbP41155 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtbP41155 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms