Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc11P31313 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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