Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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