Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxd10P28359 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxd10P28359 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxd10P28359 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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