Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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