Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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PparaP23204 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PparaP23204 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PparaP23204 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PparaP23204 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PparaP23204 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PparaP23204 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PparaP23204 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PparaP23204 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PparaP23204 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PparaP23204 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PparaP23204 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PparaP23204 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PparaP23204 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PparaP23204 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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