Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou3f1P21952 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms