Protein–RNA interactions for Protein: P20863

Gdf1, Embryonic growth/differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf1P20863 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms