Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NefhP19246 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NefhP19246 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NefhP19246 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms