Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PcnaP17918 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms