Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Defa-rs1P17533 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Defa-rs1P17533 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa-rs1P17533 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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