Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Spi1P17433 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms