Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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