Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps110-201ENSMUST00000117530 1094 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms