Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Tgfb1P04202 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Tgfb1P04202 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tgfb1P04202 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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