Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01808 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01808 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01808 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01808 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01808 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01808 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01808 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01808 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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