Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01680 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01680 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01680 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01680 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01680 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01680 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01680 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01680 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01680 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01680 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01680 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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