Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lnx1O70263 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms