Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms