Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms