Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms