Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Mterf4-201ENSMUST00000027492 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhx8O35652 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms