Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms