Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smad6O35182 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms