Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tex48-202ENSMUST00000102862 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm8834-201ENSMUST00000216459 565 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC140449.1-201ENSMUST00000214600 1459 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms