Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm8888J3QPX5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 358 ms