Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm21976J3QNN2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21976J3QNN2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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