Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms