Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r58G3X9U3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms