Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm8247F6VRJ8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8247F6VRJ8 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8247F6VRJ8 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms