Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3250E9Q1M3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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