Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myo5cE9Q1F5 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms