Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kif28pD3YXS5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms