Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd1D3YXK1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms