Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms