Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ankrd34aB2RW11 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ankrd34aB2RW11 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms