Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Trabd2bB1ATG9 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Trabd2bB1ATG9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trabd2bB1ATG9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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