Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Prr29B1ARI9 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Prr29B1ARI9 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Prr29B1ARI9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Prr29B1ARI9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Prr29B1ARI9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Prr29B1ARI9 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms